De fleste titler i BoD Bogshop gør brug af en såkaldt blød kopibeskyttelse (vandmærke). Det betyder, at den pågældende fil indeholder synlige såvel som usynlige informationer om oprindelse og køber. Læseren oplever ingen gener herved, men hvis der skulle dukke ulovlige kopier af e-bogen op, kan deres oprindelse spores.

Derudover findes der e-bøger med såkaldt hård kopibeskyttelse (Adobe DRM), som er krypteret ved hjælp af dit Adobe ID og som kun kan læses med en software som Adobe Digital Editions.

Enkelte titler har slet ingen kopibeskyttelse. Hos BoD beslutter forfatterne og forlagene, hvilken slags kopibeskyttelse den enkelte titel skal udstyres med. De rettigheder, du erhverver dig med købet af en e-bog, er dog i alle tilfælde bundet til personlig brug; det er således ikke tilladt at videregive dem til tredjemand.